لایه مدیریت که بالاترین سطح یک سیستم هوشمند را تشکیل می‌دهد، توسط نرم افزارهای SCADA و HMI بطور نظارتی انجام می‌شود. منظور از نظارتی این است که فرایندهای اتوماسیون و کنترل توسط تجهیزات هوشمند صورت گرفته و تنها تنظیمات و پارامتردهی توسط نرم افزارهای مدیریتی صورت می‌گیرد. کنترل مرکزی، مانیتورینگ، بهینه‌سازی و گزارش‌گیری چهار نقش کلیدی سیستم مدیریتی را تشکیل می‌دهند. تنها پروتکل استاندارد مدیریت ساختمان BACnet(ISO 16484-5) می‌باشد که برای مدیریت چندین ساختمان در یک پنل امکانات زیادی را فراهم می‌کند. BACnet می‌تواند از زیرساخت‌های ارتباطی مختلف استفاده کند که از جمله آنها ZigBee ، LonTalk ، Ethernet و RS485 می‌باشند.

امروزه فرایندهای اتوماسیونی بیشتر در موتورخانه و اتاقهای هواساز جهت اتوماسیون بویلر، چیلر، هواساز، پمپهای آتش نشانی و ژنراتور صورت می‌گیرد. معمولا برای هر یک از این تجهیزات یک کنترلر مستقل(DDC) استفاده شده و به هر کنترلر، تعدادی سنسور و تعدادی فعال ساز متصل می‌شود. به عنوان مثال، یک کنترلر موتورخانه ساده، اطلاعات را از سنسورهای دمای نصب شده در مسیر رفت و برگشت آب گرم سیستم گرمایشی، آب گرم مصرفی و سنسور دمای بیرون ساختمان جمع آوری کرده و مشعل بویلر و پمپ‌ها را کنترل می‌کند. BACnet و LonWorks (ISO/IEC 14908-1, -2, -3, -4) تنها پروتکل‌های استاندارد اتوماسیون ساختمان می‌باشند.

فرایندهای کنترلی معمولا برای کنترل روشنایی‌ها، سیستم HVAC اتاقها، و کنترل پرده‌ها و سایبان‌ها مورد استفاده قرار می‌گیرند. به عنوان مثال، سنسورهای حضور، با حضور افراد روشنایی‌ها را روشن کرده و با خروج آنها خاموش می‌کنند. یا با زدن یک کلید سناریو وضعیت مجموعه‌ای از تجهیزات در وضعیت از پیش تعریف شده قرار می‌گیرد. KNX (ISO/IEC 14543-3) و EnOcean(ISO/IEC 14543-3-10) پروتکل‌های استاندارد کنترل ساختمان می‌باشند.